Naukowcy właśnie ogłosili odkrycie nowego, niesamowitego powszechny wirus, który żyje w człowieku bakterie jelitowe. Otrzymał imię „crAssphage” i miał prawie sześć lat razy częściej niż wszystkie inne wirusy bakteryjne zestawione razem. Ale jak udało nam się go tak nie zauważyć? czas
Zdjęcie z otwartych źródeł
Powodem, dla którego nie znaleźliśmy crAssphage, jest to, że że nie wiedzieliśmy, że musimy go szukać. Tak to jest oznacza
Podczas gdy nowe technologie sekwencjonowania stają się coraz bardziej popularne szybkie i tanie, wciąż mają jedną słabość: oni dobre do odkrywania rzeczy, o których wiemy, że istnieją ale słabo nadają się do poszukiwania nowych organizmów. Kiedy naukowcy badają próbkę organiczną, z której czerpią zupę Fragmenty DNA wszystkich żywych istot z tym związanych próbka – bakterie, wirusy i sama osoba. Potem te fragmenty trzeba zebrać w kolejności, w jakiej możemy zidentyfikować Jeśli znajdziemy łańcuch specyficzny dla genomu niektóre bakterie – oznacza to, że znaleźliśmy tę bakterię w próbce.
Problem polega na tym, że jeśli jeszcze nie wiemy sekwencje nieznanego nam wirusa – nie możemy wykrywaj za pomocą tej techniki. Ale w rzeczywistości autor nowego Badanie crAssphage Bas Datil donosi, że są prawie nieznane 75 procent sekwencji DNA w badanych próbkach.
Zespół Datila był w stanie znaleźć nowego wirusa, używając zupełnie innego podejście oparte na prostym pomyśle: fragmenty za każdym razem znajdują się w tej samej próbce, z dużym prawdopodobieństwem są częściami jednego genomu. Tak zastosowali tę technikę nazywane łączeniem krzyżowym w celu zidentyfikowania jednej takiej grupy powtarzające się sekwencje w próbkach pobranych od 12 osób. Następnie złożyli te sekwencje w pojedynczy genom.
I otrzymali dokładnie to: wirus crAssphage, nazwany tak od jego imienia technika montażu krzyżowego, która doprowadziła do jego odkrycie. Odkryli, że crAssphage żyje w Bacteroides – wspólna grupa bakterii żyjących w naszych jelitach.
W wyniku badań zespół wykrył crAssphage w 75% sekwencje jelitowe ludzi w USA, Europie i Korei Południowej. Jesteśmy dopóki nie dowiemy się, co dokładnie te fagi robią w naszych jelitach, ale one zdecydowanie odgrywają rolę w naszym mikroorganizmie jelitowym ekosystem.
I wreszcie ciekawy fakt: naukowcy obliczyli to w naszym ciało ma około 100 razy więcej cząstek wirusowych niż faktycznie ludzkie komórki. Mamy więc jeszcze wiele do zrobienia. dowiedz się, kim naprawdę jesteśmy.
Wirusy DNA