Być może słyszałeś o Folding @ home, popularnej aplikacji, którą można uruchomić na komputerze, aby pomóc naukowcom radzić sobie z niektórymi problemami medycznymi, w tym z nowym koronawirusem.
W zeszłym miesiącu sieć wolontariuszy, którzy ją zainstalowali, rozrosła się do tego stopnia, że platforma przewyższa najpotężniejsze superkomputery na świecie.
Według dyrektora i biochemika Folding @ home, Grega Bowmana, w ostatnich tygodniach dołączyło prawie 700 000 nowych operatorów Folding @ home. To ogromny wzrost z 30 000 osób, które cały czas rutynowo używają Folding @ home.
Ma również ogromny wpływ na moc obliczeniową – sieć Folding @ home osiągnęła zdumiewające 2,4 eksaflopsy mocy obliczeniowej na początku tego tygodnia, czyniąc ją szybszą niż 500 najlepszych superkomputerów na świecie razem wziętych.
Głównym zadaniem Folding @ home jest modelowanie zachowania białek w organizmie, co leży u podstaw wielu podstawowych funkcji biologicznych.
Funkcje te obejmują infekcje wirusowe: zespół Folding @ home bada w szczególności, w jaki sposób tak zwany „kolec” wirusa SARS-CoV-2 (który w rzeczywistości składa się z trzech białek) przyłącza się do ludzkich komórek i zakaża organizm ludzki.
Jest to kluczowy sposób, aby nowy koronawirus przedostał się do tkanki ludzkiej, więc zablokowanie go może mieć kluczowe znaczenie dla przyszłych terapii i szczepień. Jeśli potrafimy zrozumieć, jak działają białka szczytowe – co robią symulacje komputerowe Folding @ home – wtedy możemy lepiej opracować leki, które je powstrzymają.
Skok białka SARS-CoV-2 w akcji. (Folding @ home / YouTube)
„Gdybyś próbował zasymulować taki proces na swoim domowym komputerze, miałbyś szczęście zobaczyć choćby część tego procesu w ciągu następnych 100 lat” – pisze Bowman na blogu Folding @ home. „Na szczęście mamy posiłki!”
Magia Folding @ home polega na tym, że rozkłada złożone symulacje komputerowe zachowania białek na mniejsze zadania, które można następnie rozdzielić na tysiące komputerów na całym świecie – z których każdy zajmuje kawałek.
Folding @ home prowadzi także wiele innych projektów związanych z koronawirusem: przetwarza dane, aby ocenić skuteczność potencjalnych leków, które są obecnie testowane w laboratoriach, oraz przeanalizować, jak koronawirus kontroluje mechanizm komórkowy po zakażeniu.